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pI/Mw批量计算工具(PItool) 1.0
软件大小:334KB
软件语言:简体中文
软件类别:国产软件 / 理科版 / 理科工具
运行环境:Win9x/Me/NT/2000/XP/2003
加入时间:2007-6-23 23:58:32
下载次数:13232
软件等级:
联 系 人:magnisoft@tom.com
开 发 商:Home Page
软件介绍:

    本工具可通过互联网向Expasy数据库批量提交蛋白质等电点及分子量计算请求,并即时接收计算结果。

使用方法及技巧
方法一:输入Swiss-Prot蛋白质识别号(ID) (如TVB5_MOUSE PEPC_HUMAN) 或 Swiss-Prot/TrEMBL登录号(AC) (如P04213 P20142),用“空格”分开,或一行一个。
例如:输入以下内容并提交......

按照方法一的方式,只提交一个蛋白质的Swiss-Prot蛋白质识别号(ID)或Swiss-Prot/TrEMBL登录号(AC)时,除返回等电点及分子量外,还将获得有关局部片段参考信息。
例如,输入ALBU_HUMAN并提交,将返回以下内容......

方法二:直接输入蛋白质的序列(单字母)。
例如,输入:

EQLWVTVYYGVPVWKEATTTLFCASDAKAYDTEVHNIWATHACVPTDPNPQEVVLGNVTENFNMWKNNMVEQMHEDIISLWDQSLKPCVK
LTPLCVTLNCTNLRNDTSTNATNTTSSNRGKMEGGEMTNCSFNITTSIRSKVQKEYALFYKLDVVPIDNT
SYTLINCNTSVITQACPKVSFEPIPIHYCA
将输出以下结果:
Theoretical pI/Mw for the protein sequence
EQLWVTVYYG ... FEPIPIHYCA :

Theoretical pI/Mw: 5.14 / 21386.24

在“方法三”前的复选框内打钩,输入某个蛋白的AC、所求序列片段的起始位置(从N段算起)、结束位置,提交后将返回此片段的分子量及等电点,并配有所求片段的序列及适当的注释。为保证等电点计算的相对准确,片段长度不宜小于5个氨基酸残基。

(详见说明文档)












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